ایلخانى خواجه را شاگردان بسیارى بوده که از محضر وى مستفید گشته و در جمله رجال علم و دانش عصر در آمده و نامشان در کتب تاریخ و رجال یاد شده است از جمله آنها:
علامه حلى ابو منصور حسن بن یوسف حلى (648- 716).
و قطب الدین محمود بن مسعود کازرونى شیرازى (634- 710).
و غیاث الدین عبد الکریم بن جمال الدین ابن طاوس (648- 693)،
و سید رکن الدین حسن بن محمد بن شرفشاه علوى استرابادى (متوفى 715)،
و کمال الدین ابو الفضائل عبد الرزاق بن احمد شیبانى معروف به ابن الفوطى (642- 723)،
و محیى الدین محمد بن شرف الدین یحیى عباسى نقیب و مدرس مدرسه مستنصریه،
و مجد الدین الیاس بن محمد مراغى،
و کمال الدین ابو محمد رضا بن فخر الدین محمد حسینى افطسى آبى از سادات و نقباء آبه،
و عماد الدین ابو على عبد اللّه بن محمد بن عبد الرزاق حاسب، ابن الخوام،
و اثیر الدین اومانى عبد اللّه (متوفى 656) مى باشند[1]

[1]براى شرح حال مفصل محقق طوسى رجوع شود به کتاب احوال و آثار خواجه طوسى بقلم نگارنده.